臺灣原住民族研究之發展一向為「他者」建構下所形成，在殖民知識的霸權之下，一直缺乏較具主體性的知識體系建構。國立東華大學原住民民族學院創立於民國 90 年 8 月，為臺灣唯一以世界原住民族為教學研究與發展課題的學術機構，其重要任務除了人才培育，更係以臺灣原住民族為主體性來建構屬於臺灣原住民族本位的知識體系為標的。本院積極倡導結合原住民學者與其他關心原住民族相關領域議題之學者，以主體價值觀點建構臺灣原住民族研究，並朝向建立屬於臺灣原住民族的知識體系為目標。